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天津特殊的军事地位和咽喉要道的地理条件，让明政府将很多重要“衙门”设在天津卫。天津的政治地位突现。
户部分司：户部为明代中央机构六部之一，设户部尚书，掌管全国土地、户籍、赋税、财政收支等要务。在天津添设户部分司，是天津卫城日益重要的一个侧影。
天津户部分司设立于宣德十年(1435年)，置主事一员，称分司主事或分司监督，职掌漕运的税收事务。起初，朝廷每隔3年委派一名主事或监督来天津检核漕粮的收存和发放，后来改为“岁一更官”，并在天津添设专门机构。之所以设立这个分司，一是由于天津漕运税款已经成为朝廷收入之大宗，二是为了“盖防奸伪之滋”，惩治那些营私舞弊的事件。
天津道：天津兵备道简称天津道，原先隶属于山东按察使司，在天津则设副使一人，故其职称山东按察副使，或称整饬天津按察司副使。兵备道署建置于弘治三年(1490年)，其职能权限比卫指挥使高。兵备道除典掌“操练军马，修浚城池”以外，还有“禁革奸弊，问理词讼，兼管运河事宜”之权。换句话说，兵备道不仅是统辖三卫军事，而且兼管司法和财政诸方面事宜，是天津设巡抚之前的一个重要机构。明政府曾在正德二年(1507年)一度裁撤了兵备道，改设捕盗御史，事隔两年，复裁革捕盗御史。又次年(1510年)，因“流贱四起，复设”兵备道，并正式改称天津道。
天津巡抚：巡抚一职虽然始于明代，但那个时候并未成定制，只是朝廷委派中央官员赴各地巡视的临时加衔。在天津设置巡抚不会迟于万历二十五年(1597年)，当时称为天津海防巡抚(或为天津登莱海防巡抚)。而当时的天津巡抚之设，原只为“倭寇朝鲜”和“防畿辅”，其职责范围有限，而且是非常之职。天启元年(1621年)由于满洲贵族兵寇辽阳，前锋吃紧，举凡调兵、筹粮、运饷乃至打制兵器等防务事宜，均以天津为基地。朝廷为了东防侵朝倭寇，北御满洲贵族南犯，拱卫京都的安全，遂于同年复设天津巡抚，直至明王朝覆亡的二十多年间，天津巡抚之设从未间断。值得注意的是，先后出任天津巡抚的万世德、汪应蛟、李邦华、毕自严等十三人，无一不是朝廷命官，并且皆以都察院右副都御史的身份巡抚天津。明朝后期的天津，在全国的地位是越来越重要了。
盐运都司：原名河间长芦都转盐运使司，后略称为长芦都转盐运使司，洪武二年(1369年)设置于沧州青县长芦镇。永乐年间省去“河间”二字，并将青州(今山东益都)分司、直沽批检所和盐运都司移驻天津，加强了天津对北平、沧州、青州等地盐务管辖和控制，对天津盐务发展有着积极作用。
巡盐部院：创设于永乐十三年(1415年)，原名长芦巡盐部院，官员称巡盐御史，多由侍郎、都御史或巡河御史兼任。在天津无常设机构明政府为查禁私盐以及惩处灶户、私贩的违法偷盗行为，曾多次派巡盐御史来天津。
督饷部院：始设于万历四十七年(1619年)，职责与巡抚不同，为总督地方粮饷的最高一级长官。在天津添设这一机构，是因为当时“以三方犄角用兵，天津为咽喉重地”。天启二年(1622年)以后，凡出任天津巡抚的官员皆兼掌督饷部院。
屯田部院：或名屯田抚院，创始时间不详。
天津清军同知：原为河间府管马厅通判，移驻天津后改为今名，负责军务、军纪等事宜。
城守营游击：添设于崇祯十三年(1640年)，旨在确保卫城安全，以防关外清军入侵。
海运、漕运总兵：前者设于永乐四年(1406年)，后者设于正德四年(1509年)，分别督运海道、河道粮饷，兼管筹建仓屯等事宜。
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